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#$Date: 2016-02-16 22:30:59 +0200 (Tue, 16 Feb 2016) $
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data_4024751
loop_
_publ_author_name
'Yuki Yoshida'
'Kunihiko Mohri'
'Kimiaki Isobe'
'Toshimasa Itoh'
'Keiko Yamamoto'
_publ_contact_author_address
;
3-3165, Higashi-tamagawagakuen, Machida
Tokyo 194-8543
Japan
;
_publ_contact_author_email       yamamoto@ac.shoyaku.ac.jp
_publ_contact_author_name        'Yamamoto, Keiko'
_publ_section_title
;
Biomimetic Total Synthesis of (\+-)-8-Oxoerymelanthine
;
_journal_name_full               'Journal of Organic Chemistry'
_journal_page_first              6010
_journal_page_last               6015
_journal_paper_doi               10.1021/jo9008645
_journal_volume                  74
_journal_year                    2009
_chemical_formula_moiety         'C22 H25 N O10 S '
_chemical_formula_sum            'C22 H25 N O10 S'
_chemical_formula_weight         495.50
_space_group_IT_number           148
_symmetry_cell_setting           trigonal
_symmetry_Int_Tables_number      148
_symmetry_space_group_name_Hall  '-R 3'
_symmetry_space_group_name_H-M   'R -3 :H'
_audit_creation_date             2009-04-24
_audit_creation_method           'by CrystalStructure 3.8'
_cell_angle_alpha                90.0000
_cell_angle_beta                 90.0000
_cell_angle_gamma                120.0000
_cell_formula_units_Z            18
_cell_length_a                   34.5631(7)
_cell_length_b                   34.5631(7)
_cell_length_c                   10.2030(2)
_cell_measurement_reflns_used    15363
_cell_measurement_temperature    93.1
_cell_measurement_theta_max      68.2
_cell_measurement_theta_min      4.4
_cell_volume                     10555.6(4)
_computing_cell_refinement       PROCESS-AUTO
_computing_data_collection       PROCESS-AUTO
_computing_data_reduction        CrystalStructure
_computing_publication_material  'CrystalStructure 3.8'
_computing_structure_refinement  CRYSTALS
_computing_structure_solution    SIR2004
_diffrn_detector_area_resol_mean 10.00
_diffrn_measured_fraction_theta_full 0.991
_diffrn_measured_fraction_theta_max 0.991
_diffrn_measurement_device_type  'Rigaku VariMax RAPID2 R'
_diffrn_measurement_method       ω
_diffrn_radiation_type           'Cu K\a'
_diffrn_radiation_wavelength     1.54187
_diffrn_reflns_av_R_equivalents  0.060
_diffrn_reflns_limit_h_max       41
_diffrn_reflns_limit_h_min       -41
_diffrn_reflns_limit_k_max       39
_diffrn_reflns_limit_k_min       -41
_diffrn_reflns_limit_l_max       11
_diffrn_reflns_limit_l_min       -11
_diffrn_reflns_number            40183
_diffrn_reflns_theta_full        68.25
_diffrn_reflns_theta_max         68.25
_exptl_absorpt_coefficient_mu    1.738
_exptl_absorpt_correction_T_max  0.956
_exptl_absorpt_correction_T_min  0.800
_exptl_absorpt_correction_type   multi-scan
_exptl_absorpt_process_details
;
    Higashi, T. (1995). Program for Absorption Correction.
    Rigaku Corporation, Tokyo, Japan.
;
_exptl_crystal_colour            colorless
_exptl_crystal_density_diffrn    1.403
_exptl_crystal_density_method    'not measured'
_exptl_crystal_description       column
_exptl_crystal_F_000             4680.00
_exptl_crystal_size_max          0.09
_exptl_crystal_size_mid          0.04
_exptl_crystal_size_min          0.03
_refine_diff_density_max         0.72
_refine_diff_density_min         -0.52
_refine_ls_extinction_coef       37(7)
_refine_ls_extinction_method
'Larson (1970) Crystallographic Computing eq. 22'
_refine_ls_goodness_of_fit_ref   0.804
_refine_ls_hydrogen_treatment    refall
_refine_ls_number_parameters     335
_refine_ls_number_reflns         4273
_refine_ls_R_factor_gt           0.0560
_refine_ls_shift/su_max          0.0000
_refine_ls_structure_factor_coef Fsqd
_refine_ls_weighting_details
'w = 1/[0.0003Fo² + 1.0000σ(Fo²)]/(4Fo²)'
_refine_ls_weighting_scheme      calc
_refine_ls_wR_factor_ref         0.1485
_reflns_number_gt                1666
_reflns_number_total             4273
_reflns_threshold_expression     F²>2.0σ(F²)
_cod_data_source_file            jo9008645_si_001.cif
_cod_data_source_block           '_compound_11'
_cod_original_sg_symbol_H-M      'R -3:H'
_cod_original_formula_sum        'C22 H25 N O10 S '
_cod_database_code               4024751
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
1 +X,+Y,+Z
2 -Y,+X-Y,+Z
3 -X+Y,-X,+Z
4 -X,-Y,-Z
5 +Y,-X+Y,-Z
6 +X-Y,+X,-Z
7 2/3+X,1/3+Y,1/3+Z
8 2/3-Y,1/3+X-Y,1/3+Z
9 2/3-X+Y,1/3-X,1/3+Z
10 2/3-X,1/3-Y,1/3-Z
11 2/3+Y,1/3-X+Y,1/3-Z
12 2/3+X-Y,1/3+X,1/3-Z
13 1/3+X,2/3+Y,2/3+Z
14 1/3-Y,2/3+X-Y,2/3+Z
15 1/3-X+Y,2/3-X,2/3+Z
16 1/3-X,2/3-Y,2/3-Z
17 1/3+Y,2/3-X+Y,2/3-Z
18 1/3+X-Y,2/3+X,2/3-Z
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_occupancy
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_calc_flag
_atom_site_refinement_flags
_atom_site_disorder_assembly
_atom_site_disorder_group
S(1) S 0.37160(4) 0.42964(4) 0.46580(11) 0.0625(3) Uani 1.00 1 d . . .
O(1) O 0.50086(10) 0.43388(10) 0.9967(2) 0.0657(10) Uani 1.00 1 d . . .
O(2) O 0.35060(10) 0.31152(10) 0.5352(2) 0.0695(10) Uani 1.00 1 d . . .
O(3) O 0.61793(12) 0.41872(13) 0.6833(3) 0.0954(14) Uani 1.00 1 d . . .
O(4) O 0.60315(15) 0.34325(16) 0.5639(4) 0.134(2) Uani 1.00 1 d . . .
O(5) O 0.51578(14) 0.27632(13) 0.5122(3) 0.1056(15) Uani 1.00 1 d . . .
O(6) O 0.46064(10) 0.37395(10) 0.4005(2) 0.0618(9) Uani 1.00 1 d . . .
O(7) O 0.51604(11) 0.44209(10) 0.4527(2) 0.0739(10) Uani 1.00 1 d . . .
O(8) O 0.39945(9) 0.40406(10) 0.4632(2) 0.0606(9) Uani 1.00 1 d . . .
O(9) O 0.38473(10) 0.45844(10) 0.5769(2) 0.0703(10) Uani 1.00 1 d . . .
O(10) O 0.37852(10) 0.44798(11) 0.3368(2) 0.0715(10) Uani 1.00 1 d . . .
N(1) N 0.41390(12) 0.32925(12) 0.6552(2) 0.0537(11) Uani 1.00 1 d . . .
C(1) C 0.48040(14) 0.45205(15) 0.6678(3) 0.0548(13) Uani 1.00 1 d . . .
C(2) C 0.49313(14) 0.46104(14) 0.7923(3) 0.0557(13) Uani 1.00 1 d . . .
C(3) C 0.48590(14) 0.42569(15) 0.8848(4) 0.0544(13) Uani 1.00 1 d . . .
C(4) C 0.45517(14) 0.37846(13) 0.8404(3) 0.0514(12) Uani 1.00 1 d . . .
C(5) C 0.45696(14) 0.36822(13) 0.6929(3) 0.0477(12) Uani 1.00 1 d . . .
C(6) C 0.45776(14) 0.40657(14) 0.6061(3) 0.0487(12) Uani 1.00 1 d . . .
C(7) C 0.40708(14) 0.38872(15) 0.5860(3) 0.0552(13) Uani 1.00 1 d . . .
C(8) C 0.38635(16) 0.33805(16) 0.5857(3) 0.0581(14) Uani 1.00 1 d . . .
C(10) C 0.40714(17) 0.28458(15) 0.6687(4) 0.0684(16) Uani 1.00 1 d . . .
C(11) C 0.44054(17) 0.28140(15) 0.5817(4) 0.0707(16) Uani 1.00 1 d . . .
C(12) C 0.48704(17) 0.31948(16) 0.6077(4) 0.0613(15) Uani 1.00 1 d . . .
C(13) C 0.49485(15) 0.35962(15) 0.6630(3) 0.0521(13) Uani 1.00 1 d . . .
C(14) C 0.53852(15) 0.39311(15) 0.6898(3) 0.0562(14) Uani 1.00 1 d . . .
C(15) C 0.57400(18) 0.38736(18) 0.6602(4) 0.0716(17) Uani 1.00 1 d . . .
C(16) C 0.5666(2) 0.3482(2) 0.6022(5) 0.088(2) Uani 1.00 1 d . . .
C(17) C 0.5237(2) 0.31472(18) 0.5762(4) 0.079(2) Uani 1.00 1 d . . .
C(18) C 0.62692(18) 0.4616(2) 0.7260(5) 0.117(2) Uani 1.00 1 d . . .
C(19) C 0.6226(6) 0.3662(6) 0.4342(16) 0.194(7) Uiso 0.50 1 d P . .
C(20) C 0.6189(5) 0.3300(6) 0.6756(15) 0.191(7) Uiso 0.50 1 d P . .
C(21) C 0.5255(2) 0.2475(2) 0.5803(7) 0.166(4) Uani 1.00 1 d . . .
C(22) C 0.47754(15) 0.40519(16) 0.4737(3) 0.0527(14) Uani 1.00 1 d . . .
C(23) C 0.54030(19) 0.43951(19) 0.3374(4) 0.113(2) Uani 1.00 1 d . . .
C(24) C 0.31677(14) 0.38639(15) 0.4841(3) 0.0615(14) Uani 1.00 1 d . . .
H(1) H 0.4863 0.4766 0.6129 0.066 Uiso 1.00 1 c R . .
H(2) H 0.5073 0.4911 0.8220 0.066 Uiso 1.00 1 c R . .
H(3) H 0.4242 0.3706 0.8619 0.061 Uiso 1.00 1 c R . .
H(4) H 0.4621 0.3584 0.8922 0.061 Uiso 1.00 1 c R . .
H(5) H 0.3949 0.3983 0.6601 0.066 Uiso 1.00 1 c R . .
H(6) H 0.4117 0.2787 0.7608 0.077 Uiso 1.00 1 c R . .
H(7) H 0.3763 0.2622 0.6425 0.077 Uiso 1.00 1 c R . .
H(8) H 0.4326 0.2822 0.4889 0.082 Uiso 1.00 1 c R . .
H(9) H 0.4394 0.2526 0.5976 0.082 Uiso 1.00 1 c R . .
H(10) H 0.5436 0.4203 0.7285 0.071 Uiso 1.00 1 c R . .
H(11) H 0.6593 0.4816 0.7320 0.136 Uiso 1.00 1 c R . .
H(12) H 0.6134 0.4585 0.8127 0.136 Uiso 1.00 1 c R . .
H(13) H 0.6142 0.4741 0.6645 0.136 Uiso 1.00 1 c R . .
H(14) H 0.6043 0.3488 0.3596 0.233 Uiso 0.50 1 c R . .
H(15) H 0.6251 0.3958 0.4340 0.233 Uiso 0.50 1 c R . .
H(16) H 0.6524 0.3696 0.4273 0.233 Uiso 0.50 1 c R . .
H(17) H 0.6363 0.3567 0.7295 0.229 Uiso 0.50 1 c R . .
H(18) H 0.6385 0.3190 0.6440 0.229 Uiso 0.50 1 c R . .
H(19) H 0.5948 0.3067 0.7283 0.229 Uiso 0.50 1 c R . .
H(20) H 0.5574 0.2574 0.5737 0.223 Uiso 1.00 1 c R . .
H(21) H 0.5079 0.2175 0.5434 0.223 Uiso 1.00 1 c R . .
H(22) H 0.5174 0.2471 0.6726 0.223 Uiso 1.00 1 c R . .
H(23) H 0.5413 0.4117 0.3393 0.112 Uiso 1.00 1 c R . .
H(24) H 0.5708 0.4650 0.3377 0.112 Uiso 1.00 1 c R . .
H(25) H 0.5249 0.4404 0.2578 0.112 Uiso 1.00 1 c R . .
H(26) H 0.3099 0.3640 0.4156 0.073 Uiso 1.00 1 c R . .
H(27) H 0.2964 0.3983 0.4764 0.074 Uiso 1.00 1 c R . .
H(28) H 0.3131 0.3725 0.5704 0.073 Uiso 1.00 1 c R . .
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_description
_atom_type_scat_dispersion_real
_atom_type_scat_dispersion_imag
_atom_type_scat_source
C C 0.018 0.009
;
International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4)
;
H H 0.000 0.000
;
International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Table 6.1.1.4)
;
O O 0.049 0.032
;
International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4)
;
N N 0.031 0.018
;
International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4)
;
S S 0.333 0.557
;
International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4)
;
loop_
_geom_angle_atom_site_label_1
_geom_angle_atom_site_label_2
_geom_angle_atom_site_label_3
_geom_angle
_geom_angle_publ_flag
_geom_angle_site_symmetry_1
_geom_angle_site_symmetry_2
_geom_angle_site_symmetry_3
O(8) S(1) O(9) 109.3(2) yes . . .
O(8) S(1) O(10) 102.5(2) yes . . .
O(8) S(1) C(24) 103.0(2) yes . . .
O(9) S(1) O(10) 119.92(19) yes . . .
O(9) S(1) C(24) 110.14(19) yes . . .
O(10) S(1) C(24) 110.44(18) yes . . .
C(15) O(3) C(18) 117.0(5) yes . . .
C(16) O(4) C(19) 111.5(10) yes . . .
C(16) O(4) C(20) 109.0(9) yes . . .
C(19) O(4) C(20) 136.2(11) yes . . .
C(17) O(5) C(21) 116.8(4) yes . . .
C(22) O(7) C(23) 113.6(3) yes . . .
S(1) O(8) C(7) 117.5(2) yes . . .
C(5) N(1) C(8) 116.0(3) yes . . .
C(5) N(1) C(10) 120.0(4) yes . . .
C(8) N(1) C(10) 122.6(3) yes . . .
C(2) C(1) C(6) 125.8(4) yes . . .
C(1) C(2) C(3) 121.5(4) yes . . .
O(1) C(3) C(2) 122.1(3) yes . . .
O(1) C(3) C(4) 121.2(4) yes . . .
C(2) C(3) C(4) 116.4(3) yes . . .
C(3) C(4) C(5) 116.9(2) yes . . .
N(1) C(5) C(4) 108.9(2) yes . . .
N(1) C(5) C(6) 101.9(3) yes . . .
N(1) C(5) C(13) 110.2(3) yes . . .
C(4) C(5) C(6) 109.7(3) yes . . .
C(4) C(5) C(13) 112.2(3) yes . . .
C(6) C(5) C(13) 113.4(3) yes . . .
C(1) C(6) C(5) 115.1(3) yes . . .
C(1) C(6) C(7) 111.4(4) yes . . .
C(1) C(6) C(22) 113.4(3) yes . . .
C(5) C(6) C(7) 101.4(3) yes . . .
C(5) C(6) C(22) 106.9(4) yes . . .
C(7) C(6) C(22) 107.8(3) yes . . .
O(8) C(7) C(6) 110.3(2) yes . . .
O(8) C(7) C(8) 110.8(3) yes . . .
C(6) C(7) C(8) 104.2(4) yes . . .
O(2) C(8) N(1) 128.2(4) yes . . .
O(2) C(8) C(7) 125.4(5) yes . . .
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H(25) H(8) 3.023 ? . 17_555
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H(28) H(26) 3.560 ? . 8_555
loop_
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O(9) S(1) O(8) C(7) 39.9(2) ? . . . .
O(10) S(1) O(8) C(7) 168.2(2) ? . . . .
C(24) S(1) O(8) C(7) -77.1(2) ? . . . .
C(18) O(3) C(15) C(14) -7.9(7) ? . . . .
C(18) O(3) C(15) C(16) 171.6(4) ? . . . .
C(19) O(4) C(16) C(15) -80.0(8) ? . . . .
C(19) O(4) C(16) C(17) 96.9(8) ? . . . .
C(20) O(4) C(16) C(15) 82.9(9) ? . . . .
C(20) O(4) C(16) C(17) -100.2(9) ? . . . .
C(21) O(5) C(17) C(12) -113.8(6) ? . . . .
C(21) O(5) C(17) C(16) 69.3(6) ? . . . .
C(23) O(7) C(22) O(6) -7.9(8) ? . . . .
C(23) O(7) C(22) C(6) 170.2(4) ? . . . .
S(1) O(8) C(7) C(6) -126.0(3) ? . . . .
S(1) O(8) C(7) C(8) 119.1(3) ? . . . .
C(5) N(1) C(8) O(2) 174.1(4) ? . . . .
C(5) N(1) C(8) C(7) -8.5(5) ? . . . .
C(8) N(1) C(5) C(4) 103.9(4) ? . . . .
C(8) N(1) C(5) C(6) -11.9(4) ? . . . .
C(8) N(1) C(5) C(13) -132.6(4) ? . . . .
C(5) N(1) C(10) C(11) -61.7(4) ? . . . .
C(10) N(1) C(5) C(4) -88.9(5) ? . . . .
C(10) N(1) C(5) C(6) 155.2(3) ? . . . .
C(10) N(1) C(5) C(13) 34.5(4) ? . . . .
C(8) N(1) C(10) C(11) 104.5(4) ? . . . .
C(10) N(1) C(8) O(2) 7.4(7) ? . . . .
C(10) N(1) C(8) C(7) -175.2(3) ? . . . .
C(2) C(1) C(6) C(5) -10.8(7) ? . . . .
C(2) C(1) C(6) C(7) 103.9(5) ? . . . .
C(2) C(1) C(6) C(22) -134.3(5) ? . . . .
C(6) C(1) C(2) C(3) 0.0(7) ? . . . .
C(1) C(2) C(3) O(1) 173.6(5) ? . . . .
C(1) C(2) C(3) C(4) -12.4(7) ? . . . .
O(1) C(3) C(4) C(5) -149.8(5) ? . . . .
C(2) C(3) C(4) C(5) 36.2(6) ? . . . .
C(3) C(4) C(5) N(1) -155.2(4) ? . . . .
C(3) C(4) C(5) C(6) -44.5(5) ? . . . .
C(3) C(4) C(5) C(13) 82.5(5) ? . . . .
N(1) C(5) C(6) C(1) 146.5(3) ? . . . .
N(1) C(5) C(6) C(7) 26.1(4) ? . . . .
N(1) C(5) C(6) C(22) -86.6(3) ? . . . .
N(1) C(5) C(13) C(12) -0.1(4) ? . . . .
N(1) C(5) C(13) C(14) 178.9(3) ? . . . .
C(4) C(5) C(6) C(1) 31.2(5) ? . . . .
C(4) C(5) C(6) C(7) -89.1(3) ? . . . .
C(4) C(5) C(6) C(22) 158.1(3) ? . . . .
C(4) C(5) C(13) C(12) 121.4(3) ? . . . .
C(4) C(5) C(13) C(14) -59.6(4) ? . . . .
C(6) C(5) C(13) C(12) -113.6(4) ? . . . .
C(6) C(5) C(13) C(14) 65.4(4) ? . . . .
C(13) C(5) C(6) C(1) -95.0(4) ? . . . .
C(13) C(5) C(6) C(7) 144.6(3) ? . . . .
C(13) C(5) C(6) C(22) 31.9(3) ? . . . .
C(1) C(6) C(7) O(8) 86.6(4) ? . . . .
C(1) C(6) C(7) C(8) -154.4(3) ? . . . .
C(1) C(6) C(22) O(6) -169.3(5) ? . . . .
C(1) C(6) C(22) O(7) 12.6(6) ? . . . .
C(5) C(6) C(7) O(8) -150.5(3) ? . . . .
C(5) C(6) C(7) C(8) -31.5(3) ? . . . .
C(5) C(6) C(22) O(6) 62.8(6) ? . . . .
C(5) C(6) C(22) O(7) -115.3(4) ? . . . .
C(7) C(6) C(22) O(6) -45.5(7) ? . . . .
C(7) C(6) C(22) O(7) 136.5(4) ? . . . .
C(22) C(6) C(7) O(8) -38.4(5) ? . . . .
C(22) C(6) C(7) C(8) 80.5(4) ? . . . .
O(8) C(7) C(8) O(2) -38.1(6) ? . . . .
O(8) C(7) C(8) N(1) 144.4(3) ? . . . .
C(6) C(7) C(8) O(2) -156.8(4) ? . . . .
C(6) C(7) C(8) N(1) 25.7(4) ? . . . .
N(1) C(10) C(11) C(12) 51.5(5) ? . . . .
C(10) C(11) C(12) C(13) -23.3(6) ? . . . .
C(10) C(11) C(12) C(17) 156.5(4) ? . . . .
C(11) C(12) C(13) C(5) -3.6(6) ? . . . .
C(11) C(12) C(13) C(14) 177.4(4) ? . . . .
C(11) C(12) C(17) O(5) 5.2(6) ? . . . .
C(11) C(12) C(17) C(16) -177.9(4) ? . . . .
C(13) C(12) C(17) O(5) -175.0(4) ? . . . .
C(13) C(12) C(17) C(16) 1.9(7) ? . . . .
C(17) C(12) C(13) C(5) 176.6(4) ? . . . .
C(17) C(12) C(13) C(14) -2.4(6) ? . . . .
C(5) C(13) C(14) C(15) -177.8(3) ? . . . .
C(12) C(13) C(14) C(15) 1.2(6) ? . . . .
C(13) C(14) C(15) O(3) 179.9(3) ? . . . .
C(13) C(14) C(15) C(16) 0.5(7) ? . . . .
O(3) C(15) C(16) O(4) -3.5(7) ? . . . .
O(3) C(15) C(16) C(17) 179.5(4) ? . . . .
C(14) C(15) C(16) O(4) 176.0(4) ? . . . .
C(14) C(15) C(16) C(17) -1.0(8) ? . . . .
O(4) C(16) C(17) O(5) -0.4(7) ? . . . .
O(4) C(16) C(17) C(12) -177.1(4) ? . . . .
C(15) C(16) C(17) O(5) 176.6(4) ? . . . .
C(15) C(16) C(17) C(12) -0.2(6) ? . . . .
